Class Hierarchy
- java.lang.Object
- org.snpeff.fileIterator.BinSeqFileIterator<T> (implements java.lang.Iterable<T>, java.util.Iterator<E>)
- org.snpeff.fileIterator.DnaSeqFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.DnaSeqIdFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.DnaSeqPeFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.BlastResultEntry (implements java.lang.Comparable<T>)
- org.snpeff.fileIterator.FastqFileIterator (implements java.lang.Iterable<T>, java.util.Iterator<E>)
- org.snpeff.fileIterator.FileIterator<T> (implements java.lang.Iterable<T>, java.util.Iterator<E>)
- org.snpeff.fileIterator.FastaFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.LineClassFileIterator<T>
- org.snpeff.fileIterator.BlastResultFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.MatrixEntryFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.LineFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.LineSeqFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.MarkerFileIterator<M>
- org.snpeff.fileIterator.GenericMarkerFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.Gff3FileIterator
- org.snpeff.fileIterator.MotifFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.RegulationFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.RegulationBedFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.RegulationGffFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.VariantFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.BedFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.BigBedFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.VariantTxtFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.VcfFileIterator (implements org.snpeff.fileIterator.parser.Parser<T>)
- org.snpeff.fileIterator.VcfHapMapFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.SamFileIterator
- org.snpeff.fileIterator.GuessTableTypes
- org.snpeff.fileIterator.MatrixEntry
- java.io.Reader (implements java.io.Closeable, java.lang.Readable)
- java.io.BufferedReader
- org.snpeff.fileIterator.SeekableBufferedReader
- org.snpeff.fileIterator.NullReader
- java.io.BufferedReader
- org.snpeff.fileIterator.TableFile (implements java.io.Serializable)
- org.snpeff.fileIterator.BinSeqFileIterator<T> (implements java.lang.Iterable<T>, java.util.Iterator<E>)