Class AtomFunctionAnalyzer


  • public class AtomFunctionAnalyzer
    extends java.lang.Object
    • Constructor Detail

      • AtomFunctionAnalyzer

        public AtomFunctionAnalyzer()
    • Method Detail

      • getNegativeNeighbourCount

        public static int getNegativeNeighbourCount​(StereoMolecule mol,
                                                    int atom)
      • isAlkylAmine

        public static boolean isAlkylAmine​(StereoMolecule mol,
                                           int atom)
      • isAmide

        public static boolean isAmide​(StereoMolecule mol,
                                      int atom)
      • isAmine

        public static boolean isAmine​(StereoMolecule mol,
                                      int atom)
      • isArylAmine

        public static boolean isArylAmine​(StereoMolecule mol,
                                          int atom)
      • hasUnbalancedAtomCharge

        public static boolean hasUnbalancedAtomCharge​(StereoMolecule mol,
                                                      int atom)
      • isAcidicOxygen

        public static boolean isAcidicOxygen​(StereoMolecule mol,
                                             int atom)
      • isAcidicOxygenAtPhosphoricAcid

        public static boolean isAcidicOxygenAtPhosphoricAcid​(StereoMolecule mol,
                                                             int atom)
      • isMemberOfNitroGroup

        public static boolean isMemberOfNitroGroup​(StereoMolecule mol,
                                                   int atom)
      • isNitroGroupN

        public static boolean isNitroGroupN​(StereoMolecule mol,
                                            int atom)
      • isBasicNitrogen

        public static boolean isBasicNitrogen​(StereoMolecule mol,
                                              int atom)